استفاده از اعضای جنین در پیونددرمانی به دو گونه امکان دارد. نخست استفاده از پیکره جنین است. جنین را می‌توان به دو دوره جنین سقط شده و جنین داخل رحم زن تقسیم کرد. اگر حفظ حیات انسانی، متوقف بر استفاده از جسد جنین سقط شده باشد، انجام آن را مجاز می‌نماید. در مورد جنینی که داخل رحم زن قرار دارد بین اعضای حیاتی و غیرحیاتی وی باید قائل به تفکیک بود. اعضایی که حیات جنین متوقف بر عملکرد آن‌ها می‌باشد، استفاده‌ی از آن‌ها در پیونددرمانی ممنوع است. اعضای غیرحیاتی را نیز می‌توان به اعضای غیرحیاتی غیرتجدید شونده و تجدیدشونده تقسیم‌بندی نمود. اعضای غیرحیاتی غیرتجدید شونده را نمی‌توان در عمل پیوند مورد استفاده قرار داد، اما اعضای غیرحیاتی تجدید شونده در صورت ضرورت عقلائی می‌تواند مورد استفاده قرار گیرد. دوم متعلقات همراه جنین از جمله سلول‌های بنیادی جنینی و خون بند ناف برای پیونددرمانی است که با توجه به وجود مصلحت عقلائی و عدم مفسده‌ی تعرض به جنین، جایز می‌باشد.