ارزیابی اخلاقی پژوهش‌هایی که از سلول‌های بنیادی حاصل از جنین انسان که قابلیت رشد و تکوین در چندین جهت مختلف را دارند به پرسش مهم اخلاقی و حقوقی درباره قداست جنین در حال تکوین و مشروعیت سقط جنین در اسلام دامن می‌‌زند. اگر چه احکام صادره از سوی فقهای اسلامی‌‌ در این‌باره از اصول رویه‌های قضایی در جرم‌شناسی مرتبط با آسیب و یا از بین بردن جنین، استنباط شده‌اند، اما شأن معنوی ادامه حیات و قداست جنین در حال تکوین روشن نمی‌‌باشد. تعریف روشنی از جنین در فقه اسلامی ‌‌وجود ندارد. از این‌رو جایگاه اخلاقی و حقوقی آن مشخص نشده است. با بررسی احکام رایج درباره مجازات درجه‌بندی شده برای سقط جنین عمدی، به ‌نظر می‌‌رسد که تکامل شخصیت انسانی جنین در دوره نه ماهه بارداری خیلی دیر به انجام می‌‌رسد. این ابهام به‌ نگرش‌های نه چندان محکمی ‌‌درباره ارزشیابی ادامه حیات جنین در احکام اخلاق‌ زیستی نوین منجر شده است. مسائل اخلاقی درباره سلول‌های بنیادین جنینی در پژوهش‌های زیست‌پزشکی و تمام شاخه‌های آن به‌ دلیل ارزش جنین، در نظر گرفته نشده است.